Zootropolis: Hayvanlar Şehri, farklı hayvan türlerinin birlikte yaşadığı modern bir şehir olan Zootropolis’te geçer. Hikâyenin merkezinde, polis olma hayali kuran tavşan Judy Hopps vardır. Judy, şehirdeki ilk tavşan polis memuru olur fakat kimse ona pek güvenmez. Bir gün gizemli kaybolma vakaları ortaya çıkar. Judy, bu olayı çözebilmek için kurnaz bir tilki olan Nick Wilde ile iş birliği yapar. İkili, soruşturma ilerledikçe şehirdeki büyük bir komplonun izine ulaşır. Film hem eğlenceli hem de önyargı, dostluk ve cesaret gibi konuları işler.